不同碳水化合物对正常人肠道菌群体外模拟效果的比较研究

为了比较不同碳水化合物对正常人肠道菌群体外模拟效果的影响，找出适合肠道菌群体外模拟的条件，研究肠道微生物体外制备方法，范彬, 尹业师, 孙刚, 等采集3名正常志愿者的粪便样品，利用以淀粉为主要碳源的培养基VI和以淀粉＋多糖为主要碳源的培养基XP，在体外模拟发酵模型中对其菌群结构进行模拟培养。通过提取发酵液细菌基因组DNA，运用PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和16S rRNA基因高通量测序来评价模拟系统的稳定性和模拟效果，通过测定发酵液短链脂肪酸含量来推断细菌代谢情况。

 

结果显示，体外发酵模型连续运行8 d后，3名志愿者的发酵液细菌PCR-DGGE条带一致，不同培养基存在特异的细菌条带。细菌16S rRNA基因高通量测序结果表明，3名志愿者的粪便样品主要由4个细菌门组成，分别是拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和放线菌门。在考虑细菌百分含量的情况下，VI培养基对3名志愿者肠道菌群的模拟相似性是0.847、0.825、0.968，XP培养基为0.927、0.926、0.836。当不考虑细菌百分含量，只考虑细菌种类时，VI培养基对3名志愿者肠道菌群的模拟相似性是0.553、0.580、0.623，XP培养基为0.617、0.520、0.574。VI和XP培养基模拟效果存在个体差异，VI培养基对志愿者3菌群的模拟效果更好，XP培养基对志愿者1、2菌群的模拟效果更好。VI和XP培养基均能较好地模拟拟杆菌和毛螺旋菌属细菌的生长，但VI和XP培养基中也存在各自特异生长的细菌。在发酵罐内检测到短链脂肪酸的含量是15～35 mmol/L，产生多的是丁酸和丙酸。

发酵系统可用于肠道细菌的模拟培养，不同碳水化合物对肠道细菌的体外模拟效果有不同影响，能体外模拟培养出相同的细菌，也有在各培养基中特异性生长的细菌，但对3名志愿者肠道细菌模拟相似性均在80%以上。

 

特点

1.内控对照已加在预混液中，无需另外配置，使用便捷。

2.高特异性，一次检测即可涵盖所有常见易感染细胞的支原体物种（包括欧洲药典规定的9种支原体）。与细菌和真核DNA无交叉反应。

3.高灵敏度，50个基因组DNA/每个反应。

4.有相应配套的支原体

基因组DNA和细菌基因组DNA，便于特异性验证。

5.有相应配套的支原体定量标准品，便于后定量检测。